Идентификация новых генов и путей трансдукции сигналов, иммунной функции и окислительного стресса топираматом для лечения метамфетаминовой зависимости на основе вторичных исходов

Format
Наборы инструментов
Publication Date
Published by / Citation
Niu T, Li J, Wang J, Ma JZ and Li MD (2017) Identification of Novel Signal Transduction, Immune Function, and Oxidative Stress Genes and Pathways by Topiramate for Treatment of Methamphetamine Dependence Based on Secondary Outcomes. Front. Psychiatry 8:271. doi: 10.3389/fpsyt.2017.00271
Original Language

Английский

Keywords
topiramate
methamphetamine dependence
gene expression profiling
clinical trial
microarray analysis

Идентификация новых генов и путей трансдукции сигналов, иммунной функции и окислительного стресса топираматом для лечения метамфетаминовой зависимости на основе вторичных исходов

Предыстория: Предполагается, что топирамат (TPM) является перспективным лекарством для лечения зависимости от метамфетамина (METH), но молекулярная основа еще предстоит выяснить.

Методы: Среди 140 МЕТ-зависимых участников, случайным образом назначенных для получения либо TPM (N = 69), либо плацебо (N = 71) в ранее проведенном рандомизированном контролируемом исследовании, 50 участников, получавших TPM- и 49 плацебо, имели в общей сложности 212 образцов РНК, доступных на исходном уровне, на 8-й неделе и на 12-й неделе. После нашего первичного анализа данных экспрессии генов мы повторно проанализировали данные экспрессии микрочипов на основе анализа латентного класса бинарных вторичных исходов в течение недель 1-12, который обеспечил классификацию 21 респондента и 31 неответчика с последовательными ответами в обеих временных точках.

Результаты: Основываясь на вторичных исходах, 1,381, 576, 905 и 711 дифференциально экспрессированных генов при номинальных значениях P < 0,05 были идентифицированы у респондентов по сравнению с неответившими на 8-й неделе TPM, плацебо на 8-й неделе, 12-й неделе TPM и 12-й неделе плацебо соответственно. Среди 1 381 гена, идентифицированного в группе TPM на 8-й неделе, 359 генов были идентифицированы как в группе TPM на 8-й неделе, так и на 12-й неделе, из которых 300 генов были обнаружены исключительно у респондентов TPM. Из них 32 гена имели номинальные значения Р < 5 × 10−3 на 8-й или 12-й неделе, а частота ложных обнаружений < 0,15 в обеих точках времени с последовательными направлениями изменений экспрессии генов, которые включают GABARAPL1, GPR155 и IL15RA в передаче сигналов рецепторов ГАМК, которые представляют собой прямые мишени для TPM. Анализ этих 300 генов выявил 7 обогащенных путей, принадлежащих к нейронной функции / синаптической пластичности, сигнальной трансдукции, воспалению / иммунной функции и категориям реакции на окислительный стресс. Никакие пути не были обогащены для 72 генов, обнаруженных исключительно в группах плацебо на 8-й и 12-й неделе.

Вывод: Это вторичное аналитическое исследование данных экспрессии генов из клинического испытания TPM не только дало согласованные результаты с результатами первичного анализа, но и выявило дополнительные новые гены и пути ответа TPM на зависимость от МЕТАМФЕТАМИНА.