Pengurangan volume yang tidak proporsional pada ganglia basal, corpus callosum (CC) dan hippocampus telah dilaporkan pada anak-anak dengan paparan alkohol prenatal (PAE). Namun, beberapa penelitian telah menyelidiki pengurangan ini dalam komunitas prevalensi tinggi, seperti Provinsi Western Cape Afrika Selatan, dan hanya satu studi yang menggunakan pelacakan manual, standar emas analisis volumetrik. Studi ini meneliti efek PAE pada neuroanatomi subkortikal menggunakan pelacakan manual dan hubungan pengurangan volumetrik di wilayah ini dengan IQ dan kinerja pada California Verbal Learning Test-Children's Version (CVLT-C), daftar tugas belajar yang sensitif terhadap PAE. Gambar berbobot T1 resolusi tinggi diperoleh, menggunakan urutan yang dioptimalkan untuk analisis neuroanatomi morfometrik, pada pemindai MRI Siemens 3T Allegra dari 71 anak kidal, 9 hingga 11 tahun [9 sindrom alkohol janin (FAS), 19 FAS parsial (PFAS), 24 non-syndromal sangat terpapar (HE) dan 19 kontrol tidak terpapar]. Frekuensi minum ibu dipastikan secara prospektif selama kehamilan menggunakan timeline follow-back interview. PAE diperiksa dalam kaitannya dengan volume CC dan inti kaudatus kiri dan kanan, nucleus accumbens dan hippocampi. Semua struktur dilacak secara manual menggunakan Multitracer.

Tingkat PAE yang lebih tinggi dikaitkan dengan pengurangan volume CC setelah penyesuaian untuk TIV. Meskipun efek PAE pada CC dikacaukan dengan merokok dan paparan timbal, analisis tambahan menunjukkan bahwa itu tidak diperhitungkan oleh paparan ini. Di antara anak-anak dysmorphic, CC yang lebih kecil dikaitkan dengan skor IQ dan CVLT-C yang lebih buruk dan secara statistik memediasi efek PAE pada IQ. Selain itu, tingkat PAE yang lebih tinggi dikaitkan dengan pengurangan volume bilateral pada inti kaudatus dan hippocampi, efek yang tetap signifikan setelah kontrol untuk TIV, jenis kelamin dan usia anak, status sosial ekonomi, merokok ibu selama kehamilan, dan paparan timbal pada masa kanak-kanak. Data ini mengkonfirmasi temuan sebelumnya yang menunjukkan bahwa PAE dikaitkan dengan penurunan volume subkortikal dan merupakan studi pertama yang menunjukkan bahwa penurunan volume kalosal mungkin berperan dalam gangguan terkait alkohol janin dalam fungsi kognitif yang terlihat pada masa kanak-kanak.